Sammenstøtet fant sted på Kanjuruhan Stadium i byen Malang da hjemmesupporterne stormet banen etter kampen mellom Arema og Persebaya Surabaya, som endte 2-3.
I alt 127 tilskuere døde. I tillegg mistet to politimenn livet, ifølge politiet og helsemyndighetene, som har opprettet et pårørendesenter etter hendelsen.
Indonesias president Joko Widodo vil ha en gjennomgang av sikkerheten på fotballkamper i landet etter det som skjedde på Kanjuruhan Stadium. I en uttalelse sier han at han håper dette vil være den siste fotballtragedien i landet.
De dødelige opptøyene beskrives som en av verdens verste stadionkatastrofer.
Skjøt tåregass
Opprørspoliti skjøt med tåregass for å få slutt på tumultene, noe som fikk mange tilhengere til å få pusteproblemer og besvime.
Hundrevis av mennesker løp til en utgangsport i et forsøk på å unngå tåregassen. Noen ble kvalt i kaoset og andre ble trampet ned.
– Rundt 180 personer blir fortsatt behandlet på sykehus, sa politisjef Nico Afinta på en pressekonferanse ifølge det statlige indonesiske nyhetsbyrået Antara.
Mer enn 300 ble kjørt til sykehus, men mange døde underveis eller etter innleggelse.
Politisjefen sa at de hadde foreslått at det bare skulle være Arema-supportere til stede på kampen, gitt rivaliseringen mellom de to klubbene i landets øverste divisjon.
Rundt 3.000 av til sammen 40.000 tilskuere skal ha kommet ut på banen, og ti politibiler ble utsatt for hærverk, ifølge Afinta.
Stanser kamper
Det indonesiske fotballforbundet PSSI nedsetter en gruppe som skal undersøke hendelsen.
- Vi beklager handlingen til Arema-supporterne på Kanjuruhan Stadium, sier forbundssjef Mochamad Iriawan i en uttalelse søndag.
Landets president har beordret forbundet til å stanse alle kamper i Liga 1 inntil en etterforskning av lørdagens dødelige opptøyer er fullført.
I tillegg får ikke Arema FC avvikle flere hjemmekamper denne sesongen.