Politiet sier demonstranter som hadde sperret Kattwyk-broen, angrep dem med pepperspray. Politiet svarte med å bruke pepperspray, batonger og vannkanoner for å spre demonstrantene.
En talsperson for demonstrantene beskriver hendelsen som «en ny topp innen politivold».
Aktivistene sperret også Köhlbrand-broen og jernbanespor som brukes av havnevesenet.
– Vi blokkerer et av knutepunktene i tysk utenrikshandel for å skape oppmerksomhet rundt konsekvensene av moderne kolonialisering, sier miljøbevegelsen Extinction Rebellion i en uttalelse om demonstrasjonen.
Det var varslet fem demonstrasjonstog i Hamburg lørdag. Det første gikk fra Altona park til en jernbanestasjon i nærheten og samlet rundt 2.000 mennesker.