Matiullah Wesa ble pågrepet mandag kveld i nærheten av der han bor i Kabul.
– Da Matiullah spurte om identitetskortet deres, tok de ham med ved bruk av makt og vold, sier broren Samiullah Wesa tirsdag.
Wesa har kjempet for lik rett til utdanning hos alle barn og unge. Han grunnla organisasjonen Pen Path.
En uke siden startet skoleåret i Afghanistan, men få elever dukket opp. Fortsatt er det forbudt for jenter å gå på skolen.
Afghanistan er det eneste landet i verden som har forbud mot skolegang for tenåringsjenter. FN har fastslått at Afghanistan nå er verdens mest kvinneundertrykkende land.