På en pressekonferanse fredag sa politiet at saken fortsatt etterforskes. Ett av sporene etterforskerne jobber med, er mulige forbindelser til Indias regjering.
Drapet på Nijjar skjedde i en forstad til Vancouver i juni i fjor. Sikh-lederen var kjent for sin støtte til en uavhengig stat for sikher i India, og indiske myndigheter beskyldte ham for terrorisme.
Statsminister Justin Trudeau sa i fjor høst at canadiske myndigheter undersøkte om indisk etterretning var involvert i drapet. India har avvist anklagene og kalt dem absurde.
Den canadiske kringkasteren CBC melder at de tre pågrepne angivelig ble hyret som leiemordere. De anklages for å ha fungert blant annet som skytter og sjåfør i forbindelse med drapet.
Ifølge CBC etterforskes mulige forbindelser til tre andre drap, blant annet på en elleve år gammel gutt i Edmonton i provinsen Alberta.
Også pågripelsen av de tre mennene skjedde i Edmonton.
Canadiske myndigheters mistanke mot India førte i fjor til en krise i forholdet mellom landene. Samtidig har den amerikanske avisa Washington Post skrevet at indisk etterretning planla et attentat på en sikh-aktivist også i USA. Indiske myndigheter har benektet også denne anklagen.