Det skriver klubben selv i egne kanaler tirsdag kveld. Wolverhampton endte på 13.-plass i Premier League forrige sesong.
Den spanske 56-åringen og klubben går hver sin vei etter en gjensidig enighet, ifølge klubbens hjemmesider.
Dermed ble det 27 kamper for Lopetegui som hovedtrener for Wolverhampton. Han kom til klubben i november i fjor.
Ifølge BBC har det i lengre tid vært usikkert om treneren kunne fortsette grunnet klubbens økonomiske situasjon.
– Selv om ambisjonen vår har vært å gå inn i den nye sesongen sammen, er det offentlig kjent at det har vært forskjellige meninger om noen sentrale temaer. Alle parter var enige om at det ville være best å skilles i forkant av den nye sesongen, sier sportsdirektør Matt Hobbs.
Wolverhampton har solgt en rekke spillere dette overgangsvinduet for å oppfylle Financial Fair Play-reglene i Premier League. Blant annet ble Ruben Neves, som var kaptein for klubben forrige sesong, solgt til saudiarabiske Al Hilal i juni.
Tidligere har Lopetegui trent blant annet Spanias herrelandslag, Real Madrid, Sevilla og Porto.
Vil du lese mer om engelsk fotball? I VGs store magasin «Våre beste menn» kan du lese historien til alle de 77 nordmennene som har spilt fotball på toppnivå i England. Magasinet er på 124 sider, og kan bestilles i vår nettbutikk (fri frakt!)
